Институт ведёт совместные научные исследования с учебными заведениями и научными организациями, среди которых можно отметить ВГАВМ, БГУ, БГАТУ, БГПУ им. Танка, БГСХА, с институтами физики им. Б.И. Степанова, животноводства НАН Беларуси, ИЖ России, АО «Метромед» (Литва), ИЭи КВ Украинской академии аграрных наук, Винницким аграрным университетом, Подольским центром по изучению туберкулёза, Всероссийским институтом стандартизации сертификации ветпрепаратов, ФГУ «ВНИИЗЖ» и другими научными учреждениями стран ближнего и дальнего зарубежья. В институте сформировались и результативно работает ряд научных школ. Выпускники аспирантуры трудятся во многих научно-исследовательских и высших учебных учреждениях Беларуси и стран СНГ.
Организатором и директором БелНИВИ с февраля 1928 по февраль 1930 года был Сергей Николаевич Вышелесский – учёный-эпизоотолог, доктор ветеринарных наук, профессор, академик, заслуженный деятель науки СССР, лауреат Государственной премии. В послевоенные годы жизнь доказала необходимость ветеринарной науки на белорусской земле.
Во главе института стояли такие научные деятели, как А.А. Бонч-Богдановский – доцент (1922–1926 гг.), Александр Сергеевич Лубкин (1926–1928 гг.), С.Н. Вышелесский (1928–1930 гг.), В.Д. Крылов – кандидат ветеринарных наук (1930–1932 гг.), Х.С. Горегляд (1932–1933 гг.), Н.Д. Мисников (1934–1937 гг.), Л.Н. Таровердов – кандидат ветеринарных наук (1937–1941, 1944–1965 гг.), М.К. Юсковец – доктор ветеринарных наук, профессор, академик (1956–1959 гг.), Р.С. Чеботарёв – доктор ветеринарных наук, профессор, академик (1959–1968 гг.), И.С. Жариков – доктор ветеринарных наук, профессор, заслуженный деятель науки БССР (1968–1988 гг.), Н.А. Ковалёв – доктор ветеринарных наук, профессор, академик (1988–1999 гг.), Н.Н. Андросик – доктор ветеринарных наук, профессор, академик (1999–2003 гг.), А.П. Лысенко – доктор ветеринарных наук, профессор (2003–2007 гг.), А.А. Гусев – доктор ветеринарных наук, профессор, член-корреспондент РАСХН (2007–2014 гг.), П.А. Красочко – доктор ветеринарных наук, доктор биологических наук, профессор, академик РАЕН (2014–2016 гг.), Ю.В. Ломако – кандидат ветеринарных наук, доцент (2016–2021 гг.), Е.А. Степанова – кандидат ветеринарных наук, доцент (2021–2022 гг.)., В.В.Жалдыбин - кандидат ветеринарных наук, доцент (2022-2023гг). В настоящее время директором является кандидат ветеринарных наук, доцент Д.С.Борисовец.
1 марта 1974 года в связи со знаменательной датой 100-летием со дня рождения Сергея Николаевича Вышелесского постановлением СМ СССР от 01.03.1974 года №149 БелНИВИ присваивается имя С.Н. Вышелесского, а в 1975 году Постановлением СМ БССР от 20.08.1975г. № 275 он переименовывается в Белорусский научно-исследовательский институт экспериментальной ветеринарии (Бел НИИЭВ) им С.Н. Вышелесского.
В 1980 году в связи с 50-летием со дня основания института Верховный Совет Белорусской ССР Указом Президиума Верховного БССР от 30.09.1980 г. награждает БелНИИЭВ
им. С.Н. Вышелесского Почётной грамотой Верховного Совета БССР за большую работу по развитию науки, активное внедрение достижений науки и передового опыта в производство.
История республиканского унитарного предприятия «Институт экспериментальной ветеринарии
им. С.Н. Вышелесского» - это сложный и трудный путь, который начался в 1922 году, когда был образован Витебский ветеринарно-бактериологический институт. В 1930 году он был преобразован в Белорусский научно-государственный ветеринарный институт (БелНИВИ), который в 1937 году был реорганизован в Белорусскую научно-исследовательскую ветеринарную опытную станцию (БелНИВОС) и Витебскую биофабрику.
Постановлением ЦК КПСС и СМ СССР от 14.02.1956 года №253 и приказом МСХ СССР от 08.03.1956 года №87 БелНИВОС отдела ветеринарии АН БССР возрождён БелНИВИ с дислокацией в г. Минске и филиалом в г. Витебске. В период с 1956 по 1968 гг. в институте функционировало 9 отделов и работало 47 научных сотрудников. В 1964 году по ходатайству МСХ и АСХН БССР Совет Министров БССР БелНИВИ был размещён на базе Минской областной опытной сельскохозяйственной станции в поселке Кунцевщина Минского района.
На основании постановления Бюро президиума НАН Белоруссии № 26 от 08.08.2002 г. институт получил название РНИУП «Институт экспериментальной ветеринарии им. С.Н. Вышелесского Национальной академии наук РБ». В 2007 году институт переименован в РУП «Институт экспериментальной ветеринарии им. С.Н. Вышелесского», который входит в состав «Научно-практического центра по животноводству НАН РБ».